2007～09年にかけて計2シーズンが放映されたTVアニメ「機動戦士ガンダム00（ダブルオー）」の完結編となる劇場版。西暦2314年、刹那・F・セイエイらソレスタルビーイングの面々は、平和を取り戻しつつある世界を陰から見守っていた。しかし、木星圏に突如として謎の異星体が出現。地球へと進路を取り始める。「エルス」と名付けられたその異星体の存在が再び地球圏に混乱を巻き起こし、ソレスタルビーイングの設立者イオリア・シュヘンベルグがかつて予見した「来るべき対話」の時が訪れたことを悟った刹那は、新たなガンダム「ダブルオークアンタ」に乗り、最後の戦場におもむく。人間同士の戦いを描いてきた数ある「ガンダム」作品の中で初めて、地球外生命体との接触や戦いを描いた。